Bei der abschließenden "System Safety Assessment" (SSA) wird die vorausgegangene Preliminary System Safety Assessment (PSSA) im Hinblick auf das zu zertifizierende physikalische System verfeinert.
Dazu werden neben den Daten über die implementierte Systemarchitektur und den Ergebnissen der PSSA wiederum auch die Ergebnisse der vorangegangenen Functional Hazard Assessments (FHAs) verwendet. Die zur Analyse eingesetzten Techniken sind auch hier wieder Fault Tree Analysis, Dependence Diagrams oder Markov-Analyse und als Ergebnisse stehen am Ende der SSA erneut (möglicherweise detailliertere) Angaben über die Auftrittswahrscheinlichkeit externer Ereignisse, eine vervollständigte Liste der Fehlerbedingungen sowie Aufgaben und Intervalle für die Gewährleistung von Sicherheit und Wartung des Systems.